牙医学大咖请注意,期刊Evidence-Based Endodontics期待您的投稿!

期刊Evidence-Based Endodontics现开放如下两个专题研究,诚邀您的优秀稿件。 专题一:牙髓学中的锥形束计算机断层扫描 我们对锥形束计算机断层扫描在牙髓学中的使用有(缺乏)多少了解? 锥形束计算机断层扫描(CBCT)在牙髓学实践中的使用率增加提出了关于我们对CBCT用于牙髓治疗方案的获益与风险存在多少实际了解的问题。在本期特刊中,我们呼吁广泛来稿,讨论CBCT在牙髓学中的不同使用方面。 首席特邀编辑 土耳其安卡拉大学Kivanc Kamburoglu教授 特邀编辑 意大利米兰大学Silvio Taschieri博士 专题二:冠折和根折的相关思考、认识和证据 伴有冲击性创伤性折断的牙冠起源折断和牙根起源折断是主要发生的牙齿折断。牙冠起源折断(COF)通常发生在未经牙髓治疗的牙齿中,具有涉及患病牙髓(活髓和坏死髓)的症状,而牙根起源折断(ROF)主要发生在根管治疗的牙齿中,具有或没有牙冠修复和涉及慢性或急性根尖周病的症状。尽管近年来,有更多关于这两种折断的信息发表在科学期刊上,但在文献中对于这两种折断错综复杂的病因、发病机理和临床表现仍存在困惑,从而令研究人员和临床医生备受挫折。关于COF和ROF的病因、发病机理以及体征和症状的思考、认识和非实证信息杂乱存在的结果就是各类出版物将它们作为一种折断进行介绍,从而导致更加混乱。在本期特别专题系列中,我们呼吁涉及冠折和根折各种主题的最新相关信息。 潜在主题包括但不限于以下内容: 牙折的病因和危险因素,包括:牙齿解剖;牙质缺陷的发展;以及咬合、牙质脱水、巨大应力和仪器对折断发生和扩散的作用。 牙折诊断和锥形束计算机断层扫描(CBCT)在诊断中的使用。 折断的临床表现:深度牙周探查以及作为潜在指标的其他临床体征和症状。 折断的发病机理。 保留折断牙齿的替代治疗。   牙植入体与相邻牙齿根折之间的关系。 首席特邀编辑 以色列特拉维夫大学Aviad Tamse教授 特邀编辑 意大利米兰大学Silvio Taschieri博士 投稿说明 在提交稿件之前,请确保您已经仔细阅读了Evidence-Based Endodontics期刊投稿指南。完整的稿件应当通过Evidence-Based Endodontics提交系统进行提交。为确保您提交至正确的专题系列,请在提交时在下拉菜单中选择合适的专题系列。此外,请在您的投稿信中指出,您希望您的稿件被收录为“冠折和根折的相关思考、认识和证据”专题系列的一部分。所有提交稿件都将经过严格的同行评审,并且获得接受的文章将在期刊中作为合集发表。 提交稿件还将获益于开放获取发表的常见优势: 快速发表:在线提交、电子同行评审和制作,令您文章的发表流程简单高效 在您所在领域中拥有高度可见性和广泛的国际读者群:开放获取发表确保您的研究工作能够获得高度可见性和最大程度的曝光 ——任何能够进行在线访问的人士均可以阅读您的文章 无篇幅限制:在线发表意味着对图表、大量数据和录像片段的篇幅没有限制 作者保留版权,根据知识共享许可协议对文章进行授权:只要文章署名正确,就可以自由重新发布并重复使用 相关编辑疑问,请联系evidencebasedendodontics@springeropen.com 注册获取文章提醒,以便随时了解Evidence-Based Endodontics期刊发表的最新文章 ,包括发表于本专题系列的最新文章!

真相|酒杯大小与酒类消费量有关吗?

据估计,过度饮酒是死亡和残疾的第五大原因。找到减少饮酒的方法有助于改善群体健康。餐具尺寸可能影响食物和饮料的消费量,而以更大的玻璃杯供应葡萄酒可以带来销售量和消费量的增加。本文中,Zorana Zupan、Rachel Pechey和Theresa Marteau向我们介绍了他们近日发表于BMC Psychology中的研究,将微饮酒行为视为这种影响的潜在机制进行检验。 我们发表于BMC Public Health中的一项最新研究发现,当相同份量的葡萄酒盛在较大而非较小的玻璃杯中时,葡萄酒销售量将增长近10%。但较大的玻璃杯如何导致销售量或消费量增加?另一项最新研究提出了一种可能性,即相同份量的葡萄酒盛在较大的玻璃杯中比盛在较小的玻璃杯中看上去量更少。这种感觉效应可能导致饮酒行为的变化,例如,较大的玻璃杯可能会促使我们喝的更快,对供应量的满足感降低,或增加与饮酒相关的愉悦感。我们希望检验这些可能的机制。 我们最近的Cochrane审查发现,较大份量尺寸和餐具增加了食物和非酒精饮料的消费,但没有发现有关酒类消费的证据。如果较大的玻璃杯如我们最近的研究所表明的那样增加酒类销售量,那么越来越多的大玻璃杯可能会阻碍旨在减少酒类消费的政策和法规的实施。鉴于酒精与2型糖尿病、癌症和肝脏疾病等疾病的风险增加相关,减少消费量将导致显著的健康获益。 研究中使用的玻璃杯   在今天发表于BMC Psychology的这项研究中,我们随机选取女大学生,在基于实验室的环境中,让她们饮用相同设计的较大(370 ml)或较小(250 ml)酒杯中一定份量的红葡萄酒(175 ml)。我们使用视频录像观察了她们的微饮酒行为(饮酒速度、数量和饮用的持续时间),并使用自我报告方法评估了她们对所供应葡萄酒的满足感和愉悦感。   我们没有发现任何证据表明,相比于从较小的玻璃杯中饮用葡萄酒,使用较大的玻璃杯改变了微饮酒行为、满足感或愉悦感。尽管如此,结果显示,无论玻璃杯尺寸如何,加快的饮酒速度和更大的愉悦感增强了进一步饮酒的欲望。   需要进一步的研究来确定较大的玻璃杯是否通过促使在酒吧或小酒馆等自然环境中加快饮酒并提升愉悦感来增加消费,同时需要更具代表性的样本。   如果确定了较大的酒杯如何能够增加酒类消费的明确机制,就可以弄清楚玻璃杯尺寸可能产生影响的情形。这可能会指导当地政策,例如,可以限制特许烟酒店提供较大的玻璃杯尺寸,从而控制酒类消费。

Genome Biology一周文献导读|2017年7月3日

文章一 Hi-C as a tool for precise detection and characterisation of chromosomal re arrangements and copy number variation in human tumours 用Hi-C技术检测人类肿瘤的拷贝数差异以及染色体重组 Louise Harewood, Kamal Kishore, Matthew D. Eldridge, Steven Wingett, Danita Pearson,Stefan Schoenfelder, V. Peter Collins and Peter Fraser http://genomebiology.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13059-017-1253-8 【导读】 染色体异位通常通过FISH检测,近年来许多人也尝试用二代测序技术在基因组范围内筛查染色体异位现象。由于基因拷贝数在异位情况下往往并没有出现变化,而且在异位断裂点序列未知的情况下,想要用二代测序完成这个任务就非常困难。本周这一工作利用Hi-C辅助二代测序完成染色体异位的检测。这是一个飞快发展的领域,就在这篇稿件进行同行评审以及修改的过程中,非常类似的工作在preprint服务器BioRxiv上发表,感兴趣的读者可以比较我们发表的这一工作和BioRxiv上另一个研究组工作的异同之处。 http://www.biorxiv.org/content/early/2017/03/28/119651 Abstract Chromosomal rearrangements occur constitutionally in the general population and somatically… 阅读更多 »

期刊Cell and Bioscience访问量最新文章精选(二)

为配合2017全球华人生物学家大会暨第十六届美洲华人生物科学学会学术讨论会的召开,BMC推出与美洲华人生物科学学会合办刊Cell and Bioscience的文章精选。如下为最新发表文章的摘要部分,更多精彩内容,请点击页面左下角【阅读原文】,进入期刊主页获取。 文章一 Kv1.3通道阻断剂(ImKTx88)可在实验性自身免疫性脊髓炎(EAE)中维持血脑屏障稳定 文章链接https://cellandbioscience.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13578-017-0158-2 摘要 背景 血脑屏障(BBB)的破坏和随后的自身反应性T淋巴细胞浸润是多发性硬化(MS)和实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)的主要特征。Kv1.3通道阻断剂已被证明可能通过减少T细胞激活,对MS患者和EAE模型具有潜在的治疗作用。然而, Kv1.3通道阻断剂是否在MS模型中维持BBB的完整性还有待探讨。 结果  在本项研究中,使用高度选择性Kv1.3通道阻断剂ImKTx88来确定Kv1.3通道在EAE发病机制中的作用,特别是在BBB维持中的作用。ImKTx88改善了EAE大鼠的病理严重程度,并减少了向CNS的外渗。ImKTx88还改善了紧密连接蛋白的损失或再分配的严重性,并且抑制了EAE大鼠脑中ICAM-1和VCAM-1的过度表达。此外,ImKTx88保护与Ang-1/Tie-2轴的激活相关,可能是由于IL-17产生减少。 结论  ImKTx88可能是通过稳定BBB而用于MS治疗的新型治疗剂。   文章二 iPSC是安全的! 文章链接: https://cellandbioscience.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13578-017-0157-3  摘要 诱导多能干细胞(iPSC)在细胞疗法中具有广阔前景。然而,潜在安全性问题削弱了其向临床发展的积极性。最受到关注的问题之一来自于观察到iPSC中存在基因组改变。来自美国国立卫生研究院(NIH)国家人类基因组研究所的Liu博士及其同事,与来自美国NIH国家心肺血液研究所的Dunbar博士所带领团队合作,使用克隆皮肤成纤维细胞和源自相同皮肤成纤维细胞的iPSC克隆的下一代测序,现已完美证明iPSC中大多数观察到的基因组改变是从亲本细胞遗传的罕见改变。他们的研究结果表明重编程过程似乎不比培养细胞的简单亚克隆更具诱变性,并且iPSC对于细胞疗法是安全的。   期刊Cell and Bioscience的简要介绍  Yun-Bo Shi博士,主编   Shi博士,NIH NICHD分子形态发生部门高级研究员兼主任,目前以个人身份担任Cell and Bioscience的总编。Shi博士于1982年在中国武汉大学获得理学学士学位,并于1988年在美国加州大学伯克利分校获得博士学位。在卡内基研究所进行博士后培训后,Shi博士于1992年在NIH NICHD设立了自己的研究小组。Shi博士通过使用非洲爪蟾蜍变态过程作为模型系统对脊椎动物发育中的甲状腺激素调节的分子基础进行研究。Shi博士已经发表了130多篇研究论文和50篇综述/图书章节,编辑了3本图书并撰写了1本关于两栖动物变态过程的专著。 目标和范围 Cell and Bioscience是美洲华人生物科学学会的官方期刊,也是一本涵盖生命科学研究各个领域的经同行评审的开放获取期刊。 更多精彩,别忘记点击页面左下角【阅读原文】进入期刊主页哟!   PS:会议期间,主编大人来到BMC展位,现场的同事表示很激动!↓

良心推荐|还在犹豫投哪本?一大波生物学精选刊在等你!

常常会有科研咖在选刊上发愁,海量的期刊,到底哪一本适合自己?又去哪里搜索到精选目录? 生物咖的福利来了,BMC的资深编辑们为你们精选了一批优质期刊。如下是期刊名称,查询影响因子,期刊投稿目标和范围,主编信息等,请点击页面左下角阅读原文进入期刊搜索页面,查找/输入对应刊名,一切跃然屏幕上!   Cell and Bioscience (BMC与美洲华人生物科学学会合办刊) Genome Biology (BMC旗舰刊之一,学科领域“大牛刊”) Genome Medicine (BMC旗舰刊之一) BMC Biochemistry BMC Bioinformatics BMC Systems Biology BMC Molecular Biology Plant Methods Rice Genetics Selection Evolution Chemical and Biological Technologies inAgriculture Standards in Genomic Sciences Molecular Cytogenetics Neural Development Journal of Neuroinflammation Journal of Biomedical Science Molecular Brain Acta Neuropathologica Communications Stem… 阅读更多 »

期刊Cell and Bioscience访问量最高文章精选(一)

为配合2017全球华人生物学家大会暨第十六届美洲华人生物科学学会学术讨论会的召开,BMC推出与美洲华人生物科学学会合办刊Cell and Bioscience的文章精选。如下为访问量最高的两篇文章的摘要部分,更多精彩内容,请点击页面左下角【阅读原文】,进入期刊主页获取。 文章一 KLF13通过激活PPARγ促进猪脂肪细胞分化 文章链接: https://cellandbioscience.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13578-015-0016-z 摘要 背景 脂肪生成受到在不同分化阶段起作用的转录因子复杂网络的严格调控。作为锌指转录因子家族中的一员,Kruppel样因子(KLF)在哺乳动物的细胞分化和发育过程中扮演着不同的角色。 结果 在本研究中,我们发现KLF13是猪脂肪细胞分化的重要调控因子。在猪脂肪细胞分化早期,KLF13的表达显著上升,从而激活PPARγ的表达。猪脂肪细胞分化通过加入KLF13的siRNA而显著减弱,而KLF13的过表达导致猪脂肪细胞分化增强。通过启动子删除和突变分析,我们在猪PPARγ近端启动子的−593/-577区域内鉴定出一个KLF13结合位点,说明KLF13直接与猪PPARγ启动子相互作用。然而,siRNA对KLF13的抑制并不影响小鼠脂肪细胞分化。此外,T3-L1细胞中KLF13敲除和/或过表达均不影响PPARγ2的表达。 结论 总体而言,我们的结果表明KLF13是猪脂肪细胞分化中重要的促脂肪生成因子,能够反式激活PPARγ的表达,而在小鼠脂肪细胞分化中没有检测到这种作用。 关键词 KLF13 脂肪细胞分化 PPARγ  转录调控 猪 小鼠   文章二 白纹伊蚊(Aedes albopictus)miRNA的表达谱受到登革病毒2型感染影响 文章链接 https://cellandbioscience.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13578-015-0009-y 摘要 背景 白纹伊蚊是登革病毒(DENV)的重要载体,并且已经快速侵入了全球热带和温带环境。一些研究已经表明,小分子RNA(miRNA)调控蚊子对病原体的防御。然而,目前还没有关于DENV感染影响miRNA在白纹伊蚊中表达的系统分析。在此项研究中,我们利用Illumina RNA测序研究了在DENV-2感染情况下白纹伊蚊的miRNA表达。 结果 在感染和未感染DENV-2的成年雌性白纹伊蚊中总共发现了103种已知和5种新型候选miRNA。比较分析显示,被感染后52种miRNA显著下调,而18种显著上调。此外,RT-qPCR验证了其中11种差异表达miRNA的表达模式。对受到调控的miRNA的靶基因预测和功能分析表明,miR-34-5p和miR-87可能参与了抗病原体和免疫应答。 结论  这是关于DENV感染对白纹伊蚊miRNA表达的影响的首个系统性研究。miRNA表达的复杂变化表明,miRNA可能通过调控免疫相关基因参与抗病毒应答。此项研究提供了有关DENV诱导miRNA的信息,并为发现可用于载体介导的抗病毒策略的潜在基因提供了新的线索。 期刊Cell and Bioscience的简要介绍  Yun-Bo Shi博士,主编   Shi博士,NIH NICHD分子形态发生部门高级研究员兼主任,目前以个人身份担任Cell and Bioscience的总编。Shi博士于1982年在中国武汉大学获得理学学士学位,并于1988年在美国加州大学伯克利分校获得博士学位。在卡内基研究所进行博士后培训后,Shi博士于1992年在NIH NICHD设立了自己的研究小组。Shi博士通过使用非洲爪蟾蜍变态过程作为模型系统对脊椎动物发育中的甲状腺激素调节的分子基础进行研究。Shi博士已经发表了130多篇研究论文和50篇综述/图书章节,编辑了3本图书并撰写了1本关于两栖动物变态过程的专著。 目标和范围 Cell and Bioscience是美洲华人生物科学学会的官方期刊,也是一本涵盖生命科学研究各个领域的经同行评审的开放获取期刊。 更多精彩,别忘记点击页面左下角【阅读原文】进入期刊主页哟! 插播市场部同事前方消息,我们的展位汇集了生物学领域的大咖们↓,据说还有HR部门的同事在暗中“招兵买马”哟,好机会不要错过,和我们一起做同事

我们应该如何定义“久坐行为”?

在科学中,对术语具有清晰且明确的定义至关重要。但是对于迅速发展的领域,例如久坐研究,关于新术语可能迅速出现混乱。International Journal of Behavioural Nutritionand Physical Activity中的新发表文章报道了久坐行为相关关键术语的最终定义。本文中,论文作者Travis Saunders向我们介绍了更多内容。 过去20年间,发表了大量使用术语“久坐行为”的研究。1997年,在Pubmed上发表的论文中有61篇使用了术语“久坐行为”。去年这一数字是1,021篇。而2017年仅在前5个月中就有474篇。 1997年到2017年间,Pubmed上发表的使用术语“久坐行为”的研究论文数量。 正如任何新领域一样,术语带来了大量混乱。许多人仍使用术语“久坐”指代其他人将会描述为“不活跃”的参与者。这看上去像是毫无意义的吹毛求疵,但它确实很重要。如果我在查找关于“久坐行为”的研究,但你称之为“不活跃”,那我的检索就不会找到你的文章。或者哪怕我看到了你的文章,我可能认为它关于不同的主题进而忽视。使用一套共同的术语可能对交流关于给定主题的研究大有帮助。 2012年,久坐行为研究网(SBRN) 公开了给编辑的一封信,提出了对久坐行为的共识定义。该信函得到了来自全世界52位研究人员的认可,并成为了久坐行为最广泛引用的定义。 然而,自2012年后,久坐行为研究领域继续演变,而最近许多作者提倡将“久坐行为”术语以及诸如屏幕时间、久坐行为模式和久坐时间中断等相关术语进一步分类。此外,研究人员已经指出原始定义不适用于某些群体,包括非常年幼的孩童和具有运动损伤的群体。 基于先前的工作,SBRN最近着手于,就久坐行为相关关键术语达成共识,并确保这些术语适用于所有年龄和体能群体。SBRN对全体成员发出号召,其中87位回复感兴趣。指导委员会对10个关键术语制定了草拟定义,然后这些定义经历来自所有87位作者的多轮评论和反馈。 最终定义(罗列如下)可在International Journal of Behavioural Nutritionand Physical Activity的发表文章中获取(其还包含用于形成定义的反复过程相关完整细节)并还通过www.sedentarybehaviour.org提供。这些定义也在2017年6月10日在加拿大维多利亚州举行的国际行为营养与身体活动学会会议上得到介绍。 我们希望这些定义将得到广泛支持和采用,并推动关于久坐行为的进一步研究、干预、政策和实践。   术语 定义 1.身体活动不足 身体活动水平未达到目前的身体活动指南。 2.静止行为 静止行为是指在躺、靠、坐、或站过程中没有进行移动的任何清醒行为,不考虑能量消耗。 3.久坐行为 久坐行为是指当处于坐、靠或躺姿时,以能量消耗≤1.5 MET为特征的任何清醒行为。 4.站 个人通过脚部支撑而具有或保持直立姿态的姿势。 5.屏幕时间 屏幕时间是指花费在屏幕相关行为上的时间。这些行为可与久坐或身体活动同时进行。 6.非屏幕基础的久坐时间 非屏幕基础的久坐时间是指不涉及屏幕使用的久坐行为花费的时间。 7.坐 个人体重由臀部而非由脚部支撑的姿势,且其中个人背部直立。 8.靠 靠是介于坐和躺之间的身体姿势。 9.躺 躺是指在支撑表面上处于水平的姿势。 10.久坐行为模式 清醒时久坐行为持续整天或整周的方式(例如,久坐开始和中断的时间、时长和频率)  

氨基甲酸酯杀虫剂能够扭转局面吗?

一项实地研究调查了如果一种杀虫剂被具有不同作用模式的杀虫剂所替代,那么蚊子种群内的杀虫剂耐药性可能会下降的原因。 框架悬挂的蚊帐。来源于维基百科 迄今为止,疟疾控制项目的成功主要归功于经长效杀虫剂处理过的蚊帐(LLIN)的分布和使用规模的扩大。不幸的是,这些蚊帐中的大多数是用一类杀虫剂,即拟除虫菊酯制成的,而该杀虫剂目前在非洲普遍产生耐药性。 目前,世界卫生组织的全球杀虫剂耐药性管理计划(GPIRM)建议,理想的措施是轮流使用不同类型的杀虫剂用于室内滞留喷洒(IRS),并结合普遍存在拟除虫菊酯耐药性的LLIN。不幸的是,可用的替代杀虫剂的数量十分有限。 拟除虫菊酯耐药性的最佳表征机制被称为击倒抗性(KDR)。KDR由编码电压门控钠通道(VGSC)的基因突变引起,从而导致对拟除虫菊酯以及DDT类杀虫剂的敏感性降低。在这些突变中,已知VGSC基因的1014个密码子中的两个单核苷酸多态性L1014S和L1014F造成若干按蚊中的KDR。先前认为这些突变起源于东非和西非,但目前在非洲普遍存在。 对于蚊子种群内这些突变的发生率及其对媒介控制项目功效的影响了解甚少。一些研究显示,不管KDR盛行率如何,LLIN都呈现出保护作用,而其他研究显示,这些突变对蚊子种群具有重大影响。 Martin Donelly及其同事在2009年对调查这些突变之间的关系所存在的困难进行了详细的审查,并且可将其总结为“kdr与对拟除虫菊酯和DDT的耐药性相关联,但没有明显证明表明,这种抗性等位基因的单独存在足以导致控制失败”。 今年早些时候,Tarekegn Abeku及其同事发表了他们的调查结果,旨在通过调查乌干达境内基于氨基甲酸酯的IRS相关基因型和表型kdr来进一步了解这一领域。 使用L1014S(kdr)作为拟除虫菊酯耐药性的代表,他们将L1014S与不同蚊子取样地点的恶虫威(氨基甲酸酯杀虫剂和拟除虫菊酯替代品)使用关联起来。 他们发现,在采用恶虫威喷洒的区域,冈比亚按蚊亚种(Anopheles gambiae s.s.)种群内的L1014S纯合性明显降低。有趣的是,他们注意到,室内收集的蚊子成虫比收集到的蚊子幼虫具有显著更多的kdr纯合子,这提示对暴露于LLIN的耐药性成虫进行选择性抽样。奇怪的是,已证明,LLIN使用和kdr纯合性之间的关联性随着降雨量的增加而加强。这被认为是由于“在具有高媒介密度的相对湿润地区暴露于拟除虫菊酯的频率增加”。 David Weetman博士 或许最深刻的意义在于,他们提出了恶虫威在逆转拟除虫菊酯耐药性方面的作用。英国利物浦热带医学院的Weetman博士进一步解释到:“杀虫剂耐药性管理(IRM)的中心原则在于,如果撤回已经发展出耐药性的杀虫剂,或者用具有替代作用模式的另一种杀虫剂来替代该杀虫剂,那么耐药性应该会下降。然而,很少有实地研究用以证明蚊子已深谙IRM规则手册。这项研究提供了耐药性的概况;即喷洒区域的kdr频率比未喷洒区域更低,这与由选择压力降低所驱动的下降相一致。研究这些突变频率动力学的时间序列将为该研究增添更多价值。先前已经证明,在目标乌干达地区,将杀虫剂从DDT和拟除虫菊酯转变为恶虫威对疟疾具有重大影响。总体而言,本文的数据表明,耐药性逆转可能是额外的有益结果,这有助于保护拟除虫菊酯对LLIN的功效”。

Genome Biology一周文献导读|2017年6月26日

文章一(植物表观遗传学特刊) The Arabidopsis SWI/SNF protein BAF60 mediates seedling growth control by modulating DNA accessibility 拟南芥BAF60通过调节DNA的可及度来介导发芽生长 Teddy Jégu,Alaguraj Veluchamy, Juan S. Ramirez-Prado, Charley Rizzi-Paillet, MagaliePerez, Anaïs Lhomme, David Latrasse, Emeline Coleno, Serge Vicaire, StéphanieLegras, Bernard Jost, Martin Rougée, Fredy Barneche, Catherine Bergounioux,Martin Crespi, Magdy M. Mahfouz,  Heribert Hirt, Cécile Raynaud and Moussa Benhamed http://genomebiology.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13059-017-1246-7 【导读】植物对光的敏感性帮助它们适应四季变化,适应昼夜更替。表观遗传调控往往是植物面对昼夜、四季更替时用来调节发育的利器。这一工作研究的是SWI/SNF的一个组成成分BAF60如何在光节律中调节染色质的开放性,从而调节相关基因的表达。这一工作之所以入得编辑“法眼”是因为其工作的完整性,并且在全基因组水平上研究发芽发育并不多见。 Abstract Background:Plant adaptive responses to changing environments… 阅读更多 »

作者与编辑同框,共同探讨无结果评审的意义

方法学上可靠的研究公开透明报道的证据的积累是科学进展的支柱。然而,对发表积极结果的偏倚扭曲了证据基础并破坏了研究的再现性。无结果评审通过在编辑决定过程中仅注重原理和方法而为此问题提供了解决方案。今天,BMC Psychology发表了首篇经历完整无结果评审过程的文章。在本文中,我们将讨论无结果评审可能对于作者、审稿人、编辑和读者的意义。 无结果评审是同行评审的新模式,旨在减少发表偏倚,防止以令人深刻的结果掩盖拙劣的方法。BMC Psychology于2016年12月启动了无结果评审;今天,来自英国剑桥大学的Zorana Zupan和同事发表了首篇经历无结果同行评审过程的文章。作者也在此博客中讨论了他们的研究。 文章作者和负责文章同行评审的副编辑Koula Asimakopoulou向我们讲述了他们对无结果评审的看法。  您认为无结果评审将怎样帮助发表过程朝向更健全的方向发展? 作者:如《可重复科学宣言》(Manifesto for Reproducible Science)中所述,无结果评审是能够改善科学过程,令其朝向研究更透明、更加可重复且更高效的目标发展的多种措施之一。无结果同行评审将发表决策的焦点从研究结果转移到了研究问题的重要性和解决方法的适当性。考虑到科学过程的各阶段相互关联,因此在评估阶段采取的措施也可能积极影响其他阶段。例如,如果正如在无结果同行评审中那样,设计是评估的关键点,那么研究人员可能更侧重确保实验的稳健设计。此外,如果成果不是评估的核心,可能促使研究人员不再热衷于通过数据疏浚(也称p值篡改)产生统计学上显著的结果来提高发表的可能性。 副编辑:众所周知,就发表而言,相比报道重要影响的研究来说,报道无效结果的研究受到有利关注的可能性更低。这种方式的困境是可能产生发表偏倚,并且在一些情况下可能掩盖我们对科学的理解,从而包含表明,例如,药物疗法不比安慰剂强的结果从不出现的情况。因此,无结果评审可能帮助进行更客观的同行评审过程。  您之前经历过发表偏倚吗? 作者:我们经历过期刊拒绝描述旨在重复并扩展先前已发表研究的研究稿件,因为稿件被认为不够新颖。 副编辑:是的——尤其是对于系统综述,它们缺少能够表明影响的研究,从而为其发表正名。 我们充分了解对于无效结果的偏倚,所以选择了我们认为能够防止此偏倚的评审过程 早在1977年,Michael J. Mahoney就发现,审稿人对无效研究的方法和质量的评判比对积极研究更加挑剔。最近,John P. A. Ioannidis证明,报道无效结果的试验发表存在大量时间延迟,无效结果比积极结果从提交到最终发表的时间多出数月。那么无结果评审能否对目前发表无效结果的障碍提供解决方案? 作者:无结果评审确实可能解决对于无效结果的发表偏倚。这是一种值得检测的设想。 副编辑:当然会。 我们对于评审过程的经历是积极的。通过评判提出的问题以及用于解决问题的方法,这看上去是对论文进行同行评审的更科学的途径。 作为作者,什么因素影响您决定选择无结果评审? 作者:我们的研究未提出任何证据,用以支持所检验的假设。我们充分了解对于无效结果的偏倚,所以选择了我们认为能够防止此偏倚的评审过程。   参与无结果评审是否影响稿件的准备或报告? 作者:我们以与所有发表文章一样的方式准备稿件,然后按顺序提交各部分。  您对以这种方式进行的同行评审有何经历?它与一般同行评审相比如何? 作者:我们对于评审过程的经历是积极的。通过评判提出的问题以及用于解决问题的方法,这看上去是对论文进行同行评审的更科学的途径。 副编辑:它帮助我关注研究的方法。我的问题是感觉失去了论文的很大一部分,在很多方面,论文可能具有很棒的方法部分,但结果是完全难以理解/分析不充分的,这最初令我很担忧。因此,感觉像是我评审了论文的一半而不是一件完整的作品,这将需要一些时间来适应!   您是否认为公开的同行评审模式进一步提高了无结果评审的透明性? 作者:公开的同行评审能够帮助建立对无结果评审的信心。此外,有证据表明公开的同行评审比匿名评审质量更高,然而还应考虑到公开身份的同行评审的潜在风险。 副编辑:几乎是肯定的。我相信我们都会有时觉得同行审稿人很苛刻,或许是无意的。我发现公开的同行评审系统激励审稿人更仔细地考虑他们的建议。  从读者的角度看,您认为无结果评审是否能改变对于研究质量的评价? 作者:无结果评审强调作为理解结果的背景的研究问题及其解决方法的重要性,从而确实有可能改变读者接触论文的方式。如果这导致发表更多具有无效结果的研究,那么将比现存的证据基础提供更能代表一个领域的证据基础。 副编辑:我认为它更着重于确保当你阅读方法部分和简介时,这两个部分很好地连接在一起并在逻辑上相关。因此从这种意义上说,无结果评审可能令论文更难通过初审,除非对于审稿人来说,得到的相关部分确实写得非常好。  在您看来,无结果评审的关键利弊是什么? 作者:无结果评审具有许多优势。除了消除对发表统计学上显著的结果的偏倚之外,如果此过程促进了大量更少偏倚研究的发表,则其还可以提高系统综述的质量并帮助产生无偏倚的假说。总而言之,这将提高科学发现的质量、可靠性和可信度。 在缺点方面,虽然我们没有经验,但是将同行评审过程分为两个阶段可能需要编辑和审稿人的额外工作,可能使同行评审过程延长。缺少形式评估,这种评审可能表现得似乎在处理研究成果评估过程中偏倚的重要来源,而实际可能并非如此,从而无意间导致其对可重复科学做出贡献的错误保证。 副编辑:优点在于明显减少发表偏倚的趋向。缺点是当你首次阅读论文时必须处理感觉不完整的问题! 您是否会预见到无结果评审将成为同行评审的“标准”? 作者:是的,我们能够预见到其成为标准。但是高影响力期刊必须带头采用这些程序。 副编辑:是的。  无结果评审为处理发表偏倚提供了可能的解决方案。然而,您认为解决此问题还需要采取哪些其他关键步骤? 作者:在《可重复科学宣言》中确定了处理发表偏倚的其他关键领域。它们包括:预登记研究、分享数据和激励良好实践。 副编辑:开辟报道无效结果研究的专门途径可能有帮助。  您对未来同行评审的贡献 全新发表倡议的数量正在增加,重要的是它们能够得到严格的评估以确保达到期望的结果。无结果评审的评估将会通过我们的随机对照试验进行,以确定该评审如何(假设存在)影响发表偏倚和编辑决策过程。如果评估有效,那我们希望无结果评审将成为同行评审的“标准”。 在重复性和无效结果均报道不足情况泛滥的领域中,BMC Psychology一直以发表所有可靠科学为信条,旨在降低发表偏倚的影响。我们从不根据人们认为的研究兴趣或研究可能的影响进行编辑决策。我们希望,无结果评审是我们对进一步提高发表研究的再现性所做出的努力的又一大特色。 BioMed Central致力于消除发表偏倚并促进再现性。作为无结果评审的补充手段,BioMed… 阅读更多 »