BMC Series 7 月精彩集锦

BMC Public Health:消除恶习 戒烟是一种挑战,而饮酒经常能够对戒烟的努力造成干扰。在英国进行的一项横断面调查中,研究人员发现,报告在上周试图戒烟的人员也在同期做出努力减少饮酒。该项研究无法断定,是否一项决定是另一项决定的诱因;然而,该发现表明政策及支持项目应当将试图克制一项以上成瘾或健康相关行为的个人计算在内。 BMC Genetics:水蛙杂种发育模型更新 水蛙(Pelophylax esculentus)是杂种发育动物的一个例子。在这种繁殖模式中,当生殖细胞发育时,亲本一方的全套染色体组从杂交动物的生殖细胞系中排除。这与传统的有性生殖不同,在有性生殖中,生殖细胞系包括来自父本和母本的重组基因物质。BMC Genetics最近的一篇文章对减数分裂阶段进行了比较基因组杂交分析并提出了杂种发育细胞机制的全新模型,表明基因排除可随后发生在减数分裂过程中,这与先前的预测不同。 本月照片:四只眼睛 研究人员通过筛选具有四只眼睛的卵鉴别出了稀有的连体双胎大马哈鱼。联体双胎共用一个卵黄囊,并且它们心血管系统也是连通的。来自BMC Developmental Biology的这篇文章详述了该共用系统的解剖和组织学特征,并且提出这些鱼可作为潜在的动物模型,用于研究连体双胞胎的心血管发育—部分原因在于透明的卵黄囊易于观察使用。 BMC Public Health:出生记录暗示肥胖的早期风险因素 有证据表明,遗传和环境因素都可能导致肥胖,然而开发出强有力的干预策略仍然是一项重大挑战。利用马萨诸塞州1980年到2008年的出生记录,发表在BMC Public Health中的这项研究提出,家庭单元结构可能是环境因素之一:研究发现,出生证明上父亲信息缺失与儿童肥胖风险因素有关。虽然这些记录缺失的准确原因和内涵尚不明确,但是该研究确实表明对早期社会因素密切关注可能有益于肥胖风险预防。 BMC Biotechnology:植物转运蛋白基础知识 ABC转运蛋白基因编码了膜蛋白的超大家族,这些膜蛋白促进范围广泛的分子进出细胞的迁移。在作物中,这些蛋白值得关注,因为它们的功能能够影响对除草剂或其他有害制剂的防御,以及植物营养。发表在BMC Biotechnology的这篇文章详述了对植物界ABC转运蛋白基因的全面转录组学分析,提供了关于这些基因在不同植物种类中的多样性和优势表达的丰富数据来源,这些数据能够应用于农作物生物技术和分子育种策略领域。 BMC Research Notes:统计数据再探 2008年发表于Journal of the American Medical Association中的一篇文章报道称美国总统大选当天交通死亡事故显著增加。另一独立研究小组利用替代统计学方法对这一耐人寻味的发现重新分析,并在BMC Research Notes发表成果称这种关联可能并不像此前报道的那样紧密—这个案例让人想起科学研究中持续不断的重现性讨论。 BMC Sports Science, Medicine and Rehabilitation:力争在损伤康复中“迅速恢复” 对女性运动员而言,前十字韧带(ACL)损伤令人虚弱无力却又并非不常见,而长时间的恢复期无论是身体上还是精神上都令人紧张不堪。为了解决这一问题并改善康复策略,一组研究人员收集了来自患有ACL损伤的女性足球运动员的身体及采访数据,并据此报道“迅速恢复”组的共同特征,包括较强的社交和互动行为、容忍并接受的态度以及设定合理目标的能力。这些“迅速恢复”的运动员普遍能够良好应对恢复性要求。本研究为医疗团队提供了建议,在康复实践中培养这些能够促进迅速恢复的品质。 BMC Obesity:学校内外的久坐行为 研究小组使用加速计以评估五年级学生在在校期间以及周末的久坐行为模式。总体而言,孩子们在校外久坐时间更长,不论在平时放学以后还是在周末,而在学校课件休息和午餐时间时进行更多体育活动。这些模式对于学校管理者和家长均是有益的,令其能够考虑鼓励日常体育活动的方式,既具有肥胖预防益处又能够提高总体健康状况。  

临床见解:非酒精性脂肪性肝病,用于中风的机器人助步车以及2型糖尿病

用于2型糖尿病的胰岛素 全球有数百万人受到2型糖尿病(T2D)侵扰。虽然T2D患者体内内源性胰岛素水平往往较高,但是如未达到血糖指标,可开方使用外源性胰岛素。然而,在此种情况下使用胰岛素的益处尚不明确。新研究并未发现胰岛素对T2D临床成效具有长期效果的显著证据。 研究人员开展了系统审查和元分析以调查胰岛素相比降血糖药物或者饮食/安慰剂在相关临床终点上的有效性和安全性。分析中包含了报告18,599例患者疗效的20项随机临床试验。 相对于降血糖药物或饮食/安慰剂而言,使用胰岛素并不影响心血管死亡率和总括性死亡率。相对于使用口服降血糖药物组而言,使用胰岛素组罹患低血糖的风险更大,但使用胰岛素却可能降低短期高血糖。对胰岛素治疗T2D的临床效果需要做更多长期试验。 Erpeldinger等,BMC Endocrine Disorders 针对中风患者的机器人助步车训练 Glucose meter Insuline pen injection and lancetes 中风患者通常受步法和平衡障碍困扰,这些会削弱他们进行日常活动的能力。i-Walker是一种机器人助行车,其检测患者施加的力,并且能够调整其给予力道不足一侧帮助的力度。最新成果表明,在治疗期间使用这种机器人设备能够改善受轻度至中度中风影响患者的步行表现和平衡。 研究人员进行了一项随机对照实验,涉及42位患有由首次单侧脑中风引起的偏身轻瘫的患者,这些患者被随机分配至标准治疗组和i-Walker组。 在四周的时间里,两组均接受了二十组标准型常规步行导向治疗,随后对照组继续进行二十组同样的治疗,而i-Walker组则使用伺服辅助机器人助步车来进行常规步行训练。 两组参与者在步行表现方面均有所改善,但是i-Walker使用组呈现出更佳的步行速度和步行能力。在六个月的随访期间,i-Walker组摔倒的次数更少。 Morone等,Journal of NeuroEngineering and Rehabilitation 非酒精性脂肪性肝病患者的维生素D补充 非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)是一种常见的肝脏病症,无医学认可疗法,常见于患有2型糖尿病(T2D)患者身上。低水平维生素D与NAFLD以及病情严重程度相关。 一项最新研究的结果表明,补充大剂量的维生素D不能改善患有NAFLD的T2D患者的肝性脂肪变性或新陈代谢以及心血管参数。 在一项随机对照实验中,65位患有NAFLD的T2D患者随机接受口服补充维生素D3(2000个国际单位/天)或安慰剂,持续24周。 介入组维生素D血清水平显著提高,而对照组没有。肝脏脂肪含量变化在不同组之间并无差异。以血清转氨酶、CK18-M30以及III型前胶原N端前肽水平,或新陈代谢以及心血管参数改变进行衡量,对肝脏损伤也不存在明显区别。 Barchetta等,BMC Medicine 临床见解由Magdalena Morawska以及Stephanie Harriman撰写

阿尔茨海默病研究的最新小鼠模型

阿尔茨海默病是老年人群中最突出的痴呆症类型。据估计,未来30年间会有大约3千万人患上这种疾病,这将带来巨大的财政和社会负担。因此,我们需要建立成功的治疗策略。为实现这一目标,可以用于对发病机理研究的合适模型以及相关的知识都是必不可少的。 目前仅少数患者的阿尔茨海默病的起因是明确的,即遗传。全部患病人群中约有1-3%在三种已知的与阿尔茨海默病密切相关的基因中携带变异。 其中一个基因编码了一个定位于细胞表面的在神经元细胞的信息交流中起到重要作用的蛋白, 被称为淀粉样前体蛋白(APP)。多种酶将该蛋白质切分成遗传有不同功能的较小片段。这种被裂解的产物——β-淀粉样肽可以最终在患者大脑中形成沉积(斑块),疑似就是偶发的非遗传性突变的患者患上阿尔茨海默病的罪魁祸首。 细胞表面APP的裂解:有多种酶可以使APP裂解。导致阿尔茨海默病的重要途径包括由α-分泌酶ADAM10和β-分泌酶BACE-1所引起的裂解。后者产生神经毒性的β-淀粉样肽,这种物质在疾病的发病机制中起着关键作用,并最终导致神经元的死亡。与之相反,由α-分泌酶引起的裂解会产生一种可溶性蛋白质片段(其被称为APP-α),该物质具有保护神经元并为其提供营养的性能。 几乎所有用于研究阿尔茨海默病的动物模型都建立在该疾病的遗传变异的基础之上。将人类疾病的罕见遗传变异中三个已发现的变异基因引入老鼠的基因组中成为这些研究模型的建立基础。因为偶发性阿尔茨海默痴呆症患者并不携带有这些变异, 所以这些建立在基因变异的先决条件之上的模型并不适合于大多数患病人群的情况。 直接向小鼠的大脑中注射β-淀粉样肽是模拟病理性肽毒性作用的另一种替代性的研究方法。这种使用纯肽注射的方法能够在模拟患者临床特征的受试动物身上引起分子层面以及行为层面上的改变, 例如:学习和记忆,这类在阿尔茨海默症患者身上受到严重限制的能力,在注射了β-淀粉样肽的小鼠身上也会被削弱。 然而,直接对大脑进行注射需要特殊的设备和经验丰富的研究人员。所以我们研究创建了一种新型的模型用于研究β-淀粉样肽诱导的病理性改变。该模型可用于阿尔茨海默病典型病症的研究,并且易于操作。 这是一种通过由鼻至脑的途径直接向大脑施用物质的方法。经鼻给药通过三种主要的递送路径将物质送入大脑:嗅觉器官,吻侧迁移流和三叉神经, 由此达到了一种覆盖从嗅球到后脑的几乎所有大脑区域的快速递送方式。特别是在啮齿类动物身上,构成鼻腔的巨大表面积不仅使得它们能够凭借嗅觉确定方向,还易于经鼻投送药物和其他物质。 β-淀粉样肽的经鼻应用:用移液器吸头将肽经由鼻腔进行施用。如图示,经由嗅觉上皮(绿色部分),肽迅速进入大脑,并通过一种尚不明确的机制对行为产生影响。 我们把一种含有β-淀粉样肽的溶液用移液器吸头流入野生型小鼠的鼻孔,然后检查该肽的分布以及对学习和记忆的影响。 我们发现在投送β-淀粉样肽的仅一个小时后整个大脑中都可检测到相应的肽信号。不仅在紧邻鼻子的大脑区域有高浓度的β-淀粉样肽,位于远离鼻孔处的小脑也显示出现β-淀粉样肽。 不仅如此,经β-淀粉样肽处理的小鼠也表现出学习和记忆能力受损。我们首先对小鼠进行一轮特殊的训练,使其将一个音调或某种环境与微弱的脚部电击相联系形成反应。第二天测试时,当这种音调或环境再次出现,小鼠就会通过一种被我们称为“冻结”的固定行为反映出它们对这种不愉快场景的记忆能力。结果显示: 提前一日经鼻施用了β-淀粉样肽的小鼠在测试中显示的记忆能力比对照小鼠降低了50%。 我们需要进一步的详细研究以弄清该种新型小鼠模型能够在多大程度上模拟这种复杂的人类疾病, 但从目前的结果来看这确是一种易于操作的,可用于研究偶发性阿尔茨海默病的主要致病因素之一——β-淀粉样肽所致的病理性改变的模型方法。将来,该模型方法可以被广泛应用于β-淀粉样肽靶向的治疗方法的分析以及研究特定的病变机理中。

是敌是友;蠕虫的益生菌能力能够预防克罗恩病

最近一项关于蠕虫和克罗恩病的研究,描述了毛首属鞭虫如何通过制造保护性肠道菌群、促进“有益”肠道菌类并抑制破坏性促炎细菌的繁殖从而调节免疫系统。这项研究支持关于罹患炎性和自身免疫性疾病的卫生假说,并打开药物开发的潜在新路径。 忘掉达能碧悠酸奶,丢开优诺酸奶,也放下那罐希腊酸奶吧。如果你想来一剂真正的益生菌精华,给自己来顿鞭虫餐吧。 最近一篇由Ramanan 等人发表的关于蠕虫和克罗恩病的文章,描述了毛首属鞭虫如何通过制造保护性肠道菌群、促进“有益”肠道菌类并抑制破坏性促炎细菌的繁殖从而调节免疫系统。这项研究支持关于罹患炎性和自身免疫性疾病的卫生假说,并打开药物开发的潜在新路径。 卫生假说 卫生假说形成于1989年,其被提出用于解释西方国家过去几十年中观察到的突然出现且快速增加的过敏、自身免疫性及炎性疾病。该理论认为,城市化和工业化所带来的卫生条件的改善和饮食及环境的变化,降低了儿童接触微生物和寄生虫的机会,这导致免疫反应性的提高以及过敏反应和自身免疫性疾病的发展。 就卫生假说早已开展了大量的研究,并得到越来越多来自流行病学调查、动物研究和早期临床试验方面的支持性结论。然而,若要阐明支撑卫生假说的庞杂机制还有很多工作要做。通过对该领域的研究可能会发现自身免疫性疾病治疗方法的新来源。 目前受到推崇的卫生假说机制包括: 1型、2型辅助T(Th1-Th2)细胞调节:Th1细胞产生炎性细胞因子,如伽马干扰素(IFN-γ)和白细胞介素2(IL-2),以激活细胞介导免疫并杀死细胞内病原体。与之相反,触发用于清理细胞外寄生虫的Th2具有某些抗炎性细胞因子,如IL-10 及IL-5。它们具有相反相成的互逆关系;降低Th2能够调节Th1,反之亦然。当不存在病原体时,这二者之间的不平衡与自身免疫性疾病有关。 抗原竞争:共存的抗原能够同时触发实际上相互抑制的不同免疫反应,这被称为抗原竞争。因此,针对一种病原体所产生的强烈免疫反应可能会抑制较弱的免疫反应。 非抗原性配体:病原体能够通过非抗原特异性受体,增强对于单独由其抗原所引起的过敏的防护作用。 基因与环境的相互作用:与感染控制关联的分子编码基因所具有的多态性,可能也与过敏及自身免疫性疾病有关。 宿主、蠕虫和微生物群 卫生假说的一个关键原理,与我们体内世代遗传的微生物所具有的免疫调节属性有关。人类、肠道菌群和肠内寄生虫共同经历了数千年的进化(参见我之前关于我们世代相传的寄生虫—毛首鞭形线虫的博文),这导致了复杂的物种间相互作用,而由于我们暴露于感染环境的机会日益减少,这种相互作用还有待确认。 我们已经知道蠕虫能够触发Th2免疫反应,由此下调Th1促炎性细胞因子。其还能够调节宿主的Th2反应,由此抵消免疫球蛋白E的活性。免疫球蛋白E是一种抗体,其能够防止蠕虫感染,但也与某些过敏反应有关,如湿疹、枯草热、食物过敏以及先天性过敏(一种遗传性易产生过敏症的体质)人群所患的哮喘。肠道菌群可能会受益于由蠕虫感染所触发的Th1下调。针对马来西亚感染蠕虫和未感染蠕虫的个体体内微生物群的构成和生物多样性的研究表明高蠕虫感染与增加的微生物多样性之间存在联系。 此类研究发现能够帮助我们了解自身免疫性疾病,如炎症性肠病(IBD)。有研究表明,在这些疾病中,微生物群的构成和多样性对IBD病理起着至关重要的作用。尽管克罗恩病等IBD,可能有不止一个起因,并受到多种遗传和环境因素的影响,研究显示,某些肠道菌群可能会加强或削弱IBD病理。 最近,一组研究人员开展了动物实验,以阐明宿主-蠕虫-微生物之间相互作用影响克罗恩病的复杂机制。作者们所使用的小鼠患有Nod2基因缺陷,已知这种缺陷会使宿主易于罹患回肠克罗恩病。Nod2基因缺陷的特点在于,在产生肠道保护性粘膜层的小肠杯状细胞中存在某种缺陷。弱化的粘膜层使得肠道中普通拟杆菌等促炎性细菌得以繁殖,这种繁殖是致病性的且与Nod2缺陷宿主具有较高IBD病变几率有关。 使具有Nod2缺陷的小鼠感染鼠鞭虫。结果表明,鼠鞭虫感染导致了小肠杯状细胞的囤积,由此抵消了遗传缺陷并加强了黏膜屏障。此外,他们还发现鼠鞭虫感染触发了Nod2缺陷小鼠的Th2反应。这使得微生物群中,普通拟杆菌的数量大幅减少,而梭菌目细菌的数量有所增多。 Ramanan等认为,由鼠鞭虫触发的免疫反应在具有Nod2缺陷的小鼠体内创建了一个适合于有益肠道的梭菌目细菌的繁殖环境,这种细菌或者在争夺营养方面超过拟杆菌目细菌,如普通拟杆菌,或者释放出一种对促炎性细菌有害的毒素。 通过将这些结果与在马来西亚农村(蠕虫病高发区)与城市(蠕虫病低发区)的居住人口进行关联,作者们观察到,与生活在城市地区的居民相比,农村地区居民体内肠道微生物群具有高水平的微生物多样性,特别是具有较高水平的梭菌目细菌,且具有低水平的拟杆菌目细菌。甚至更加吸引人注意,或者说更加令人担忧的是,在农村地区,驱虫活动导致梭菌目细菌的数量降低以及拟杆菌目细菌的数量增高!要了解这是否与使用阿苯达唑治疗后Th2免疫反应下调有关,还需要进一步的研究。 由Ramanan等进行的这项研究,证明了蠕虫感染如何通过调节免疫系统促进了有益健康的肠道细菌的繁殖,从而间接预防Nod2相关的克罗恩病。该研究还有助于解释蠕虫治疗为何不是总能获得期待的效果,其原因在于该种治疗可能仅在由Nod2 缺陷引起的IBD病例中有效。 此类研究将有助于阐明自身免疫性疾病的复杂性,并确定全新治疗目标,用于IBD等自身免疫性疾病的不同病因。该研究还对卫生假说及其机制提出了新的见解。  

Genome Medicine一周更新

Genome Medicine为BioMed Central旗舰刊之一,影响因子5.7。本期推荐该本期刊最新论文。 单细胞TCRseq: 根据单细胞RNAseq,成对复原T细胞受体中的全部T细胞α及β链转录物 T细胞受体(TCR)α及β链谱型的准确表征对于理解适应性免疫而言至关重要。这种表征在诸如疫苗开发及反应、癌症的克隆跟踪以及免疫疗法等领域中应用广泛。本文中我们提出了一种被称为单细胞TCRseq (scTCRseq)的新方法,该方法用于根据成对末端单细胞RNA测序的读取结果,对全长重排的V(D)J T细胞受体序列进行确认和组装。通过该方法可以对每个单独的T细胞进行V(D)J重排的准确确认,该方法还具有复原成对α及β段的新功能。源代码请参见https://github.com/ElementoLab/scTCRseq。 肿瘤谱分析方法的影响以及用于癌症精准医疗的基因组数据策略 临床肿瘤谱分析方法的多样性(从使用少部分到使用整个外显子组,采用匹配的或不匹配的种系分析)可能会导致其优势和可靠性的不确定性,特别是考虑到,在仅针对肿瘤的谱分析中报道的种系假阳性以及对全局突变及/或新抗原数据的使用。本研究的目的在于,确定基因组分析策略在不同背景和起源下对错误率和数据解读的影响。

记录重复 – 别对试验注册中心期望太高

试验注册旨在为健康研究提供全面而多义的视角。然而,当用户利用 世界卫生组织国际临床试验注册平台(WHO ICTRP) 等综合性网站进行检索时,他们常常发现关于同一试验的多条记录,正如发表在《 Systematic Reviews》的这篇文章 中所报道的那样。在本文中,Helene Faure将解释为何会发生记录重复以及能够为突出试验注册中心之间重叠进一步采取的措施。 事实又或是注册中心的日常 目前WHO采用的注册中心代表不同具体地理区域并旨在确保全面以及权威,但是他们也不得不适应健康研究的现实以及其协作性的本质。同一研究可能被列入不同的来源中。WHO ICTRP国际准则 中同样承认,“试验将可能需要注册多次,以满足各个国家的道德、法律或其他方面的要求”。 语言因素同样不容忽视。许多注册需要参与者使用当地语言,而这就需要额外工作以当地语言和ICTRP目的要求的英语(巴西注册中心提供三种语言备选)筛选整理信息。即便在英语作为使用语言的注册中心,目标也可能不同:有些注册中心关注高度结构化内容(如ClinicalTrials.gov),而有些注册中心旨在提供通俗英语总结(如ISRCTN)。 即便享有相同的价值观,每个注册中心都具有自己的创建宗旨。记录重复因此是我们工作中的常见问题。 当面临重复时,综合性网站最开始犹豫是否他们应该考虑创建“最佳”记录以总结所有重复内容。这就意味着创建另一需要耗费大量人力的额外筛选整理层面,而实际上不同层面的信息服务不同目的,且读者也将自行决定哪条记录能够提供更多信息。对于“已识别重叠应当被抹消还是以更佳的方式呈现”的问题,“我选择后者”。 对于“已识别重叠应当被抹消还是以更佳的方式呈现”的问题,“我选择后者”。 突出重复 承认重复存在并不意味着注册中心没有采取措施追踪重叠的性质以及范围。 根据国际准则,“如果一项试验在一个以上注册中心注册,那么该试验的所有已知标识符都应提交给每个注册中心作为辅助标识符。前述应当包括其他注册中心分配的试验注册号”。 所有注册中心均提倡科研人员核查其研究是否业已注册(例如,参见澳大利亚新西兰注册中心“注册”指南)。而后,注册中心各自的编辑团队展开一系列交叉核查,审核条件、国家、资助方、赞助方、研究人员姓名、参与研究人数等等,以确定新提交项目是否与已有项目重复。 核查结果最终都会反馈给申请人。这可能导致需要澄清题目或记录的某些方面以消除与其他已有记录是否存在混淆。跟踪和/或巢式研究有时会带来其是否能够确认自身试验ID的问题。ISRCTN实行通用规则,同时也考虑个案情况。通常根据题目和编者按等领域可以做出清晰判断。 此类核查并不意味着失误从未发生。WHO ICTRP最小数据集多年来的发展变化显示描述一项研究需要多个元素。内部重复的可能性不高,例如,在创建10余年以来的14,600多条记录中,ISRCTN注册中心仅撤回了不到40条记录。 WHO ICTRP利用文数试验ID作为注册中心之间的关联。各个注册中心都十分留心记录来自其他注册中心的无论是在具体领域(主要针对存在较大重叠可能性的那些注册中心,例如ClinicalTrial.gov或者欧洲注册中心EU-CTR)还是在辅助ID领域的“关联”。辅助ID领域也将包含对数据提供者有用的信息,即便所含信息出于注册中心需要平衡当地需求和国际标准目的而不是公认的试验ID。 受监管职权范围限制,目前EU-CTR在运营上稍有不同。其底层数据库EudraCT最初设计用于接收来自欧盟所有成员国的试验详细信息。重复自始存在,但定期发布统计对记录条目和试验数量做出区分。几个月之后536/2014号欧盟条例将生效,届时中心信息呈现方式将可能发生变化。 寻找、识别并标记隐藏重复条目(即,那些不从其它注册中心引用试验ID的记录)似乎是一项永远无法完工的任务。说实话,注册中心1肯定业已核查一项试验未被列入构成注册中心2中重复的可能对象,但是研究会发展,也会加入新的国家,而原始注册中心又可能未被及时通知。 别对注册中心期望太高 识别不同数据来源之间的重叠可以看作是数据整合资源的职责。但是,这篇文章已经清楚表示这一工作相当耗费人力。WHO ICTRP 通用试验编号(UTN)曾一度被视为可行解决方案,但是其从未明确编号如何能够实际解决这一问题,鉴于编号未与模糊描述试验的数据集实现精准结合,也不能公开获取用于计量。 WHO ICTRP官网等门户网站通常没有足够的资源筛选数以百计的记录而不得不缩限其服务范围,无法提供针对试验的全面综合性“一站式资源”。ICTRP侧重鼓励最佳临床实践,同时也正计划添加新的数据元素。对结果报告目前正存在火热讨论,鉴于多数注册中心只收录源自试验的出版物,而纳入更多有益数据反馈对于门户网站具有重大意义。 WHO ICTRP正在研究结果收录标准 其他利害相关方也需参与其中。医药赞助方在将来可能会被要求向WHO ICTRP做出有关EU-CTR反馈的简单提交,但是他们也极有可能仍需继续遵守当地规定。 各大注册中心均希望记录能够定期更新并欢迎随时指正。ISRCTN尤其鼓励读者以及系统审核人员在发现能够关联其他实验ID时与其取得联系,方便确保WHO ICTRP更高效地呈现相关记录。 注册中心试验信息能够随时更新 注册中心经常被问道“在x国有多少独一无二的试验正在y条件下进行”。为了更全面地回答这个问题,注册中心只能指向其他注册中心和/或数据整合资源并强调注意事项。一项重大注意事项就是,正如这篇文章所强调,重叠记录一直以来都被低估。 新注册中心“不断涌现”并不必然致使重复记录的识别变得更为艰难。新近授权注册中心会更加关注这一问题并做出相应规划。为了满足当地需求,注册中心可能还会关注国际药物试验范围之外并因此不在他处注册的研究,并因而帮助WHO ICTRP更广泛的涵盖世界范围内的临床试验信息。

欧洲肝病患者协会与Hep-CORE:发起行动监测欧洲各国乙型肝炎病毒(HBV)和丙型肝炎病毒(HCV)防治工作

Tatjana Reic是欧洲肝病患者协会的主席。在本文中,她将谈及开创性的Hep-CORE研究以及监控各国对于消灭病毒性肝炎工作的重要性。 2016年迄今,我们对病毒性肝炎的防治工作已经卓有成效。随着近期世界卫生组织(WHO)首次推出病毒性肝炎全球卫生领域策略,世界各地的利害关系方开始团结起来,共同为实现在2030年消灭作为公共卫生威胁的病毒性肝炎这一WHO目标做出努力。 这一策略基于能够获得的最佳科学证据为我们提供了一系列普遍的策略指引以及需要采取的首要行动。该策略因此是各国用以制定对于其国内病毒性肝炎疫情更具针对性应对措施的重要工具。 Tatjana Reic在2016年国际肝脏大会上发言 然而,我们仍然缺乏机制,用以系统评估国家层面消灭病毒性肝炎的举措是否随着时间的推移有所加强。 欧洲肝病患者协会(ELPA)期待能够早日见证世界卫生组织正在筹划当中的监控框架的问世。与此同时,我们认为采取行动刻不容缓,因为每天都有患者由于病毒性肝炎未得到治疗引起并发症而死亡。 Hep-CORE研究 ELPA在2016年年中委派了Hep-CORE研究,通过记录ELPA成员国现正如何处理乙型肝炎病毒(HBV)和丙型肝炎病毒(HCV)防治和治疗工作,来协助填补欧洲各国中的监控空白。 初步Hep-CORE分析中包含的23个国家中仅有14个国家报告具有病毒性肝炎应对策略。 Hep-CORE研究招募了一个ELPA成员小组或者说来自各国的小组联盟以完成针对各国HBV和HCV应对中关键领域的调查。调查主题包括针对病毒性肝炎的政策、疾病监控、防止、检测以及治疗。ELPA的老朋友,研究人员Jeff Lazarus,与我们以及备受推崇的国际研究小组协作共同开发了这一涵盖全面的调查。 在开始数据收集后的短短三周时间里,我们获得了ELPA成员小组的热情配合。针对一些主题的数据已在23个国家初步收集完毕,而数据信息也引起了我们的关注。 例如,尽管在2014年世界卫生大会就已经通过有关病毒性肝炎的决议,呼吁所有WHO成员国制定并执行相关国内政策,然而初步Hep-CORE分析中包含的23个国家中仅有14个国家报告具有病毒性肝炎应对策略。而这14个国家中有3个国家的相关策略并没有考虑HBV而仅仅关注HCV。 作为肝炎患者,我们已经做好准备、愿意并有能力就各国在消除病毒性肝炎的挑战中取得进步提供帮助并由此迈入有所担当的时代。 政策空白 其他调查问题关注为注射吸毒人群(PWID)提供危害降低服务,这一群体尤其容易感染病毒性肝炎。尽管由调查对象所代表的23个国家中有18个国家声称具有阿片类药物替代疗法在其各自全国境内均可获得,这23个国家中仅有7个国家报告称在全国境内中均具有针头和注射器计划。考虑到病毒性肝炎危机中注射行为的主要推动作用,这一政策空白可能对一些欧洲国家带来灾难性后果。 尽管各种类型的利害相关方在共同消灭病毒性肝炎的努力中扮演着重要的角色,不论是在全球中做出政策制定榜样,还是在地方层面对预防以及治疗服务提供流行病学监测,在未来的几个月到几年里,患者群体做出的贡献仍将无可替代。 通过提出倡导以及专业建议以促进欧洲政府对HBV和HCV采取更多启发性的应对举措,ELPA的患者群体已经在许多方面显示了他们的能量。随着Hep-CORE研究的开展,我们将进一步深入参与。作为肝炎患者,我们已经做好准备、愿意并有能力就各国在消除病毒性肝炎的挑战中取得进步提供帮助并由此迈入有所担当的时代。 我们热切盼望能够见到Hep-CORE调查的完整结果,这一结果将在今年晚些时候报道。 更多关于Hep-CORE的信息可以通过本篇来自ELPA的新闻发布获取。

管中窥豹公众科学

BMC Ecology 今日出版的增刊关注公众科学在帮助科研人员收集数据中的作用。在本博客中,该增刊的策划人Poppy Lakeman Fraser将讲解究竟什么是公众科学,以及科研人员如何依赖这种形式的数据收集。 康沃尔鹿园农场OPAL土壤调查 “‘来看看我们找到了什么!’一个十几岁的小男孩上气不接下气地边喊边沿坡朝我跑来”。 作为一名OPAL社区科学家,Matt Keyse在OPAL科学家博客中分享了同参与“昆虫计数调查”的学生一起进行的一项典型活动。参与实际科研活动无疑是学以致用的一种方式,但是这能同样为科学家和政策制定者带来持久益处,还是仅仅是一项名称动听的科学交流工具? 在近一期关于公众科学的BMC Ecology增刊中,作者们通过他们在户外实验室(Open Air *Laboratories, OPAL),如今迎来其创办第十个年头的一家全国性公众科学网络中的经验探索这一问题。 作者们将探讨公众科学现象包括哪些,为什么人们选择将自己宝贵的时间贡献给数据收集,能够成就哪种类型的科学领域以及与这一多目标学科相关联的挑战如何如何获得处理解决。 大家正在热议的这一新兴运动到底是什么? 有关公众科学的定义和原理不胜枚举,但是归根到底,其主要工作领域无外乎其字面含义:公众科学关于公众(即,非专家自愿参与的大众成员)参与(专业科学家、政策制定者或者他们自身理念所驱动的)科学。 尽管志愿者进行数据收集早在数个世纪前就已存在(甚至远在达尔文测量雀类喙长之前),该当代概念源自民主和意识增强理念(参见 Davies等关于公众科学进化的内容)。 数据收集,曾经富足“绅士科学家”的保留权利,如今在科技支持数据采集、存储、可视化和解读的全新浪潮下向所有人敞开了大门。 如今,您可以立刻报告发现患病白蜡树以用于政府官方监控,在电脑上花费十分钟弄清楚您体内蛋白质的结构,或者利用一整年时间改善您所在区域的栖息环境并监控其对授粉昆虫的影响 。实际上,通过scistarter.com网站,您甚至可以搜索到能够“在汽车中”或者“在钓鱼的同时”进行的项目。 为什么人们争先恐后地想要参与其中? 学习和回馈意识作为人们之所以期望参与其中的重要驱动力而经常被提及。不过,这仅是其中一小部分原因。Everett等在最新发表的论文中不仅探讨了人们早期期望参与的原因,还探讨了鼓励以及阻止人们保持参与的因素。一名参与者反馈说: “我觉得OPAL活动深入,这很好,让我感觉自己做的事情很‘科研(sciencey)’—这是我新学到的一个词。这让我有兴趣带着研究的心理更进一步,而不仅仅是在一个领域乱转或瞎忙,尽管这些活动很不错。” 公众科学所言所语 如果您在ISI Web of Knowledge上检索公众科学,就此主题您可以得到大约12,000篇文献,或者您也可以钻研关于此学科的全文教科书。通过发表系列建立在来源于其八大全国性调查的发现基础之上的报告和论文,OPAL对这一全新的文献领域做出了贡献。其在《BMC Ecology》中最新发表的论文探讨源自OPAL生物多样性调查以及OPAL水质调查的结果。 Gosling等在对生物多样性调查的数据进行分析后发现,市区里的灌木篱墙是野生动物重要的栖息地,树篱紧邻的硬质表面对植物和无脊椎动物群落都具有重要影响。 Rose 等对OPL水质调查—英国水体质量与清澈度全国性评估的分析发现几乎30%的湖泊都可划入优质水准。该论文还强调了利用公众科学数据面临的一项巨大挑战,即业余人士收集数据的可靠性。 评估 处在拓展与研究的交界处,公众科学不可避免地面临适应目标、操作方法以及产出的挑战。在此,Lakeman-Fraser等探讨了某些取舍并提出可操作解决方案,引导通过这些泥泞区域。 您也能出一份力 所以,如果通过以上您对发现公众科学如何能够改变世界(或者您的世界)产生了兴趣,那么请前往OPAL官方网站—网站刚推出了关于授粉昆虫的全新调查。 又或许您已经是一名公众科学项目的参与者,同时希望与他人进行交流并学习—您可加入英国生态学会公众科学特别兴趣小组或者欧洲公众科学协会 (ECSA)。 今年五月,振奋人心的ECSA国际大会已经在柏林举行,总部位于美国的公众科学协会以及澳大利亚公众科学协会将负责举办明年的交流大会—欢迎参加!

BMC Biology一周更新

常见问题与解答:究竟什么是外泌体? 摘要 外泌体是一种细胞外囊泡,其首次被描述报道是在三十年前,并自此被发现参与细胞间通讯和疾病状态传导,且被探索作为医药开发的一种方式。然而,关于其生物学的根本问题却一直未得到解答。在本文中,我将着重探讨外泌体是什么、突出外泌体研究中存在的难题并解答目前对于外泌体的定义以及外泌体生物学中的一些突出问题。 记忆是什么?印迹的现状 摘要 记忆机制一直是生物学领域一个悬而未决的巨大难题。早在一百多年前,德国动物学家理查德·塞蒙(Richard Semon)就尝试过探讨该问题,并构想了印迹,头脑中源自同步“刺激”的持久联系,这一概念,当时的生物学水平限制了进一步探索其准确的物理性质以及作用。而神经科学家如今却拥有解决这个问题的知识以及工具,本次论坛汇集了对记忆机制和印迹当下含义的当代主流观点。 BMC Biology 是BioMed Central旗舰刊之一,最新影响因子6.97.

11本BioMed Central旗下实力期刊,你怎能错过?

目前,BioMed Central旗下将近300本生物、医学领域的开放获取期刊,其中185本期刊被SCI收入。今天,我们遴选其中11本,本本质量优异,颇受中国作者喜爱。随即附上中文Aims & scope,供您参考。 Genome Biology 11.313 Genome Biology全面涵盖以基因组和后基因组角度开展研究的各生物学及生物医学领域,刊物内容包括研究、新方法与软件工具,以及综述、意见和评论等文章类型。本刊涉及领域包括但不限于:序列分析;生物信息学;分子、细胞及有机体洞察;功能基因组学;表观基因组学;群体基因组学;蛋白组学;比较生物学与进化;系统与网络生物学;疾病基因组学;以及临床基因组学等。全部内容一经刊登即可开放获取。 BMC Medicine 8.009 BMC Medicine以透明性和可达性为精神,是一本开放获取型同行评审全科医学杂志。本刊所发表的优秀而富影响力的研究涵盖广泛,遍及临床实践、转化医学、公共卫生、政策以及生物医学研究界所关注的一般性主题等各个领域。作为BMC系列中的旗舰医学期刊,我们还发表令人兴奋的辩论和评语,以及独特的论坛文章和简明教程。 BMC Biology 6.967 BMC Biology是BMC系列中一本旗舰生物学期刊,同时也是开放获取出版事业的先驱。我们的范围包括涉及生物学各领域的研究与方法文章、综述、问题答疑和评论,并且秉承将选择特殊关注重点与为广大作者提供优质服务的承诺相结合的出版方针。 为应对文章经反复审稿才能发表造成的延迟困扰,我们开展着一项重审退出政策,借此让作者能够选择是否让审稿人看到其修改文本(参见编辑评论:问题答疑:重审退出与无痛发表)。凭借广阔的一系列特定主题姐妹刊物,以及可转移式同行评审政策,我们能够针对无法在本刊发表的文章,帮助作者以最小的延迟寻找到适合的杂志。 Genome Medicine 5.700 Genome Medicine发表兴趣领域广泛的高品质同行评审文章,是一本立足基因组与高通量技术、医学发现和临床应用前沿的开放获取型期刊。 Microbiome 9.000 在例如微生物调查、生物信息学、元组学方法以及群落/宿主相互作用建模等微生物群落研究方面,广泛论述相关主题的文章都有机会在本刊发表。Microbiome希望通过这样一套文献设置,使得跨微生物生态学大量代表性分支学科拥有共同科学目标的研究人员汇集在一起。 Particle and Fibre Toxicology 8.649 Particle and Fibre Toxicology是一本多学科杂志,内容侧重于理解颗粒和纤维与一般环境和工作环境暴露相关的物理性质和化学过程,以及由此产生的人体健康不利影响(毒性)。 本刊作为一本开放获取型同行评审期刊,针对广大毒理学家,以及来自材料科学、生物材料和纳米医药等生产和开发颗粒和纤维材料的其他领域的科学家们,提供了一个辩论和交流的论坛。此外,由于旧有材料的新应用和新材料的采用,在多种多样的情况中颗粒都可能构成毒性威胁。针对所有这些学科,Particle and Fibre Toxicology提供了一个具有高辨识度的单一发文渠道。 Molecular Neurodegeneration 6.510 Molecular Neurodegeneration是一本开放获取型同行评审期刊,广泛涵盖分子及细胞层面神经退行性疾病研究的各个方面。神经退行性疾病是指由神经退化造成的神经系统疾病,包括但不限于阿尔茨海默氏病、帕金森氏病、亨廷顿氏舞蹈症和朊病毒疾病。这些疾病常与高龄相关,都显示出不同程度的痴呆症,并已随着人类寿命延长和老龄化人口增多而成为一个重大的公共卫生问题。在这些神经退行性疾病发病机理的基础分子和细胞机制方面的最新进展,已使人们得以对疾病机理获得更好的了解。 Biotechnology for Biofuels 6.444 Biotechnology for Biofuels是一本开放获取型同行评审期刊,以描述生物燃料、化学品和其他生物产品生产中的技术及运营进展的高质量研究为特色。本刊侧重于理解和促进生物技术与协同运营应用,从而完善以生物质、源于生物质的中间体或CO2为原料,以生物法生产这些产品的工厂和生物转化系统,以及生物质生物转化所不可或缺的上下游运营。 Journal of… 阅读更多 »